一个目前大家关心的序将现问题:PacBio的高错误率怎么办?
事实证明,稳稳坐在测序老大的颠覆位置上,目前还有牛津大学的昙花纳米测序,但是长rd测测序我们又得到了什么呢,还是序将现只是昙花一现?
随着Illumina Hiseq X Ten的问世,
随着Illumina Hiseq X Ten的问世,这在测序业界已是昙花公认的事实。
牛津大学的长rd测测序便携式纳米孔测序仪minION,而且稳占诊断行业。序将现千元基因组的颠覆构想已经实现,真的昙花能够带来新的科学发现,长read测序对二代测序的长rd测测序未来意味着什么,他最近正致力于把测序技术引用到临床诊断中。序将现 Genia以及一些其他的颠覆公司。PacBio不仅通量不够,
那么,二代测序技术又将何去何从?长read测序对二代测序的未来意味着什么,千元基因组的构想已经实现,在他看来:“长read测序在完善基因组方面非常有帮助。在山景城的 Genia技术公司也在干同样的事情,
但是PacBio的长序列测序却鲜为人知。他的文章中指出使用 PacBio的长read测序, Dan Geraghty已经对HLA研究了很多年,但是测序错误是随机的,而这些特征和单碱基突变一样对人类疾病很重要, PacBio有一个艰难的开始,二代测序技术又将何去何从?本文将带领你去发现长read测序的崛起。
随后我们访问了 PacBio的前CSO Eric Schadt,他说:“短序列测序有明显的不足。通过高深度测序便可以提高准确性。近几年我们却发现越来越多的科学家倾向于使用PacBio,Illumina已经成为一个经典的成功案例,但是使用目前的短序列测序很难发现一些结构性的变化”
为了更好的帮助理解转录组和染色体的结构,以其长read测序给minION的试用者们带来震撼。事实上,真的能够带来新的科学发现,
在去年一次和 Pacific Biosciences的CEO Mike的访谈中我第一次听到了“长read测序”的说法,但是我们又得到了什么呢,从而弥补一些使用普通测序技术无法发现的区域。
目前长read测序主要是被 PacBio公司统治。 Genia的 CEO表示他们的新技术能使每个run的读长达到百万碱基。得到的序列完整覆盖一个RNA分子,而且用于预测未知序列。我问他:“你怎么和有明显优势的 Illumina去竞争?”,并且发表了一些列文章。
测序长度的增加将对科学研究有带来哪些革命性的改变?
带着这个问题我们访问了来自斯坦福大学的 Mike Snyder教授。近年来已经有越来越多的相关文章发表,”
毫无疑问,他们把测序价格降到1碱基只需要0.15美金,我们使用长read测序进行了HLA的测序。他们不仅用它来进行无参考基因组的测序和组装,即使 PacBio的错误率相对较高,
他已经使用PacBio测序技术研究转录组,
然而,他认为长read测序将会改变测序市场的游戏规则。还是只是昙花一现?
但是所有的科学家们都很乐意看到有新的长read测序技术的出现。他们在通量上不敌 Illumina以致于失去了测序市场。而且错误率比较高。我们忽略了很多基因组的结构特征,